ClustalW というツールを知って知っていますか？
ClustalWは、アミノ酸配列の整列（アラインメント）ができるツールです。
例えばfugureのように様々な種のアミノ酸配列をアラインメントすると、共通の部分が見つかります。
図 アミノ酸配列をclustalWでアラインメントした結果をプロファイルで表した図 ( [1] 参照)
このようにアラインメントをすると、配列の保存された領域や類似パターンを比較することができます。
木下研究室では糖鎖構造でもアラインメントできるツールが開発されました。
このツールがあれば複数の糖鎖構造から共通する単語や結合を揃えて整列させた構造を可視化できます。(figure)
図 糖鎖構造をMCAWでアラインメントした結果をプロファイルで表した図 ( [1] 参照)
糖鎖構造をアラインメントすることによってレクチンが認識する構造パターンを検索することができます。（レクチンについてはこちら）
それでは、実際にMCAWを使ってみましょう！
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